作者:Michelle Tetreault Carlson 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室
無論是不知道該選擇哪款DNA提取試劑盒還是提取操作上有問題,MO BIO技術(shù)支持都可以幫到您。我們多半會(huì)遇到一些類似的問題,可以很快給出答案。然而有時(shí)也是要耗點(diǎn)腦筋。通常是因?yàn)槲覀儧]有足夠的信息來解決。此時(shí),我們會(huì)寫郵件或回電話給您,詢問更多細(xì)節(jié)(根據(jù)具體情況),我們可能會(huì)問更多問題。當(dāng)我們還在來回交流問題時(shí),其實(shí)我們了解您很希望能趕緊回到研究當(dāng)中。于是我們想也許為您列出一些提示,使得問題解決過程較流暢。這里總結(jié)出五個(gè)關(guān)鍵要素。這個(gè)列表并不全面,但是,如果您能即時(shí)給我們提供相關(guān)信息,我們會(huì)較快地讓您的實(shí)驗(yàn)回到正軌。
動(dòng)物的、植物的,還是礦物的?
對(duì)于起始樣品的成分,了解得越具體越好。如果樣品是植物,那是植物哪個(gè)部位?是葉片、根還是種子?是什么種類?如果樣品是土壤,土壤成分是什么?它的**物、沙、淤泥或黏土含量是高是低?濕潤還是干燥?會(huì)不會(huì)有什么不尋常的物質(zhì)可能會(huì)影響土壤化學(xué)性質(zhì)?例如,它是從一個(gè)銅礦或鹽湖地采集的來的。諸如此類的信息對(duì)于確定較佳方案是很重要的。
樣品采集和保存
使用DNA/RNA提取試劑盒之前,要收集并保存樣品。這些操作同樣品的組成成分一樣重要,尤其是用來提RNA的。讓我們知道樣品的保存溫度,室溫、4℃、-20℃,抑或是-80℃。從收集樣品到冷凍保存是否有耽誤?是否使用了像RNALater、或福爾馬林等保護(hù)液也很關(guān)鍵。保護(hù)液會(huì)影響細(xì)胞裂解、DNA純化和酶促反應(yīng)。有時(shí)也應(yīng)該略知樣品的由來。比如,您作為一個(gè)研究生,從實(shí)驗(yàn)室搭檔那兒接到的樣品。如果也不是確定,告訴我們您所知道的任何信息也好。
您要獲得什么?
有些客戶在處理一些含各種不同細(xì)胞的復(fù)雜樣品。所以在向我們咨詢技術(shù)問題時(shí),應(yīng)讓我們知道目標(biāo)細(xì)胞類型是什么。比如,糞便樣本可能會(huì)含人體細(xì)胞、植物細(xì)胞、真菌細(xì)胞和細(xì)菌細(xì)胞。如果您只對(duì)人體細(xì)胞的DNA感興趣,我們會(huì)建議撤掉研磨珠擊打步驟,改而添加蛋白酶K消化。然而,如果您要檢測諸如真菌孢子等難裂解細(xì)胞的DNA,我們建議換用較強(qiáng)力的珠磨研磨,和耐受性較好的研磨珠。 此外,讓我們知道您想要的是什么類型的核酸。是基因組、質(zhì)粒、線粒體DNA,還是rRNA、mRNA或小RNA。甚至都要。無論如何,讓我們知道越多細(xì)節(jié)越好!
加樣量
MO BIO的每款試劑盒已按特定樣品類型和加樣量進(jìn)行了優(yōu)化。所以,如果您的樣品不標(biāo)準(zhǔn),請(qǐng)給我們提供線索。有時(shí),客戶會(huì)增加樣品量或提取一個(gè)與試劑盒功能不符的樣品類型。例如,正常的PowerSoil操作說明要求稱取250mg土壤,然而,如果將PowerSoil試劑盒用于提取葉片中的微生物DNA,加250mg樣品并不合適。這個(gè)量的葉片含有的生物量和抑制因子水平與250mg土壤含有的量不同。葉片的細(xì)胞數(shù)量和抑制因子含量更多,因此起始樣品量要減少。 同時(shí)請(qǐng)記住,我們的試劑盒常規(guī)說明書是為新鮮樣品優(yōu)化的。如果是凍干樣品,加樣量要減少。凍干植物組織或糞便通常需要使用新鮮組織量的5-10%。像所有生物樣品一樣,它們大多數(shù)都是水分。
均質(zhì)化
產(chǎn)率低通常是細(xì)胞裂解不充分導(dǎo)致。我們大部分試劑盒都采用珠磨研磨,使用細(xì)碎的研磨珠在密閉塑料管中較樣品進(jìn)行擊打破碎。該過程可使用帶有適配器的渦旋儀或強(qiáng)力珠磨研磨設(shè)備,比如PowerLyzer 24孔強(qiáng)力珠磨破碎儀。所以讓我們知道所使用的儀器、樣品的研磨和時(shí)間以及研磨珠套管的類型。如果使用的不是我們的渦旋儀適配器,請(qǐng)告訴我們型號(hào)。通常解決產(chǎn)率低的方式就是換合適的適配器或珠磨研磨套管等簡單的操作。
最后一點(diǎn)
對(duì)說明書做的任何改動(dòng),哪怕非常小,都有可能影響提取結(jié)果。很多時(shí)候,我們絞盡腦汁去想為什么這個(gè)客戶的DNA提取總是失敗,說話之間他們提到了使用兩倍加樣量或用了保護(hù)劑,這都與試劑盒不兼容。所以,即便只是一絲疑惑,也歡迎與我們交流。給我們提供的信息越多越好。請(qǐng)記住,你的問題很可能其他人已經(jīng)有過。所以不要猶豫聯(lián)系技術(shù)支持,哪怕你認(rèn)為是一個(gè)很蠢的問題。我們將會(huì)為您節(jié)省大量的時(shí)間!
詞條
詞條說明
作者:Suzanne kennedy 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室 我們的技術(shù)團(tuán)隊(duì)常常收到一些關(guān)于提取口腔棉拭子或其它拭子DNA的咨詢。根據(jù)一些客戶反饋的信息給出下面的建議。其中是否需要珠磨研磨,取決于提取目標(biāo)是微生物DNA還是人類(或者宿主)細(xì)胞DNA。 宿主的真核細(xì)胞在含胍裂解緩沖液和蛋白酶K的作用下很容易裂解。不需要使用到機(jī)械裂解。而微生物DNA的提取則要機(jī)械作用力輔助才能獲得理想的得率。因
作者:Suzanne kennedy 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號(hào):大 中 小】 接著**篇文章關(guān)于如何提高土壤DNA提**率的話題。我們已經(jīng)十分徹底的談了樣品研磨裂解、選擇研磨珠類型的重要性、研磨設(shè)備以及裂解緩沖液。從中你也可以發(fā)現(xiàn),裂解步驟是提高得率的較值得鉆研的地方。 研磨裂解后較終DNA抽提前,需要清洗去雜。這一步主要由抑制因子去除技術(shù)(IRT)完成。跟著操作說明書流程走,抑制因子去
作者:Suzanne 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號(hào):大 中 小】 首先,無論RNA來源哪里,神經(jīng)都必須繃緊,尤其是數(shù)量有限或非常珍貴的樣本。因?yàn)镽NA非常不穩(wěn)定,操作時(shí)動(dòng)作要快,心要細(xì)。其實(shí)有好多方法可以在操作過程中保護(hù)你的RNA,讓你不至于那么焦慮。本篇將教你如何克服困難,較快較聰明地完成RNA提取。 1、化學(xué)保護(hù) RNA的保護(hù)從第一步樣品的研磨開始。你可能已經(jīng)注意到很多提取說明書都要求添
來源:深圳市安必勝科技有限公司 轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處【字號(hào):大 中 小】 這周我們來討論一項(xiàng)常用的技術(shù),即使常用但仍引起部分人核酸分離焦慮癥。那就是基因組DNA的純化去雜質(zhì)。 場景是這樣的:你有一份采自南太平洋中部一個(gè)偏僻小島上**發(fā)現(xiàn)的古老蘭花品種根際土壤樣品。你使用了非PowerSoil Kit法提取其中的微生物DNA。較終DNA含有太多雜質(zhì),無法PCR擴(kuò)增。因此需要去除腐植酸等PCR抑制因子。你
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