PCR實驗室是指能在短時間內(nèi)擴(kuò)增出目的基因片段的生物工程技術(shù),應(yīng)用于病毒檢測、病原體快速鑒定、個體識別、遺傳診斷及基因等領(lǐng)域。
在此次中, PCR實驗室主要應(yīng)用的技術(shù)包括:病毒全基因組擴(kuò)增與測序、核酸雜交技術(shù)與熒光原位雜交技術(shù)等。
下面是關(guān)于 PCR實驗室檢測的相關(guān)內(nèi)容,希望能對您有所幫助。
PCR實驗室檢測可分為:樣本前處理和樣本后處理兩個部分:
本文主要介紹樣本前處理中的 PCR實驗室檢測,如有需要也可查看參考文獻(xiàn)或咨詢相關(guān)專業(yè)人士。
由于試劑盒等不能保證完全覆蓋實驗結(jié)果,我們需要根據(jù)實際情況做一些針對性處理,如:核酸擴(kuò)增的條件是否合適、實驗試劑對實驗結(jié)果影響程度、實驗室人員技術(shù)水平以及實驗室空間等因素都會影響實驗結(jié)果。
一、PCR擴(kuò)增條件
1.水: PCR擴(kuò)增的過程中,由于核酸濃度高,需要大量清水,一般采用無菌水進(jìn)行稀釋到10-50 mg/mL范圍內(nèi);
2.電泳主要是通過施加電壓讓 DNA聚合酶與模板進(jìn)行化學(xué)結(jié)合,在一定時間內(nèi)將模板復(fù)制出來;
3.引物的種類、濃度以及長度對 PCR結(jié)果有很大影響;
4.模板: PCR擴(kuò)增反應(yīng)的結(jié)果受模板的影響比較大,因此 PCR實驗室應(yīng)建立自己的模板庫。
5. Taq酶:如果實驗用 Taq酶進(jìn)行擴(kuò)增,需根據(jù) DNA反應(yīng)體系選擇適當(dāng)?shù)?Taq酶;
6.擴(kuò)增產(chǎn)物的分析: PCR實驗室擴(kuò)增產(chǎn)物可通過質(zhì)譜檢測(LC-MS/MS)。
二、試劑的選擇
實驗中常用的試劑有: DNA凝膠電泳試劑(如: PAGE、SDS-PAGE、 SV或SPE-PCR等)和熒光定量 PCR試劑(如 MassA等)。
DNA凝膠電泳和熒光定量 PCR所用探針的選擇與其擴(kuò)增效率相關(guān),一般需根據(jù)實驗?zāi)康膩磉x擇探針。
如果實驗需要比較高濃度的引物,應(yīng)選擇非特探針(如: MassA);如果實驗是需要檢測低濃度(例如1μg/μl、5μg/μl)的目標(biāo),則可選擇特探針。
熒光定量 PCR的常用探針有:引物和探針類型是影響檢測結(jié)果的重要因素之一。
不同的檢測方法對于每個步驟都有特殊要求,選擇適當(dāng)類型的引物和正確使用適宜濃度的探針對提高檢測結(jié)果是至關(guān)重要的。
由于不同種類引物可能造成相同區(qū)域重復(fù)擴(kuò)增,因此應(yīng)盡可能用相同引物和相應(yīng)區(qū)域引物;在相同 PCR反應(yīng)條件下,選擇較合適、較穩(wěn)定且易于保存和使用的引物會得到擴(kuò)增效果;在相同 PCR條件下,也可以選擇較穩(wěn)定且容易獲得擴(kuò)增產(chǎn)物的引物-金標(biāo)準(zhǔn)探針,但應(yīng)注意該引物并不能保證一定在擴(kuò)增反應(yīng)中得到結(jié)果。
三、檢測試劑盒對實驗結(jié)果的影響程度
首先要明確檢測試劑盒對實驗結(jié)果的影響,一般情況下:
如果實驗需要,則需要先用試劑盒進(jìn)行確認(rèn)。
在實驗過程中,由于使用的試劑較多,可能會出現(xiàn)假陰性情況(即未擴(kuò)增出核酸)。
由于 PCR檢測的靈敏度和特都很高,對于假陽性結(jié)果應(yīng)立即做其他檢查。如果是特殊情況,如:臨床樣本檢測不到核酸時,可以先使用試劑盒進(jìn)行確認(rèn)。
最后一個問題:實驗室空間的問題。
四、檢測樣品的保存條件
PCR擴(kuò)增所需的較適溫度為37℃,在低溫下,擴(kuò)增效率會明顯降低。
此外還需要注意的是:溫度越高,擴(kuò)增效率越低。
PCR擴(kuò)增反應(yīng)需要2-4℃或4-8℃的相對低溫環(huán)境中進(jìn)行,所以 PCR檢測室要保證環(huán)境溫度在15-30℃。
由于實驗所用液體一般都是有一定粘度和流動性的樣品,為了避免核酸變性、減少樣品變性、降低試劑成本等原因,需要對核酸進(jìn)行保護(hù)(加入 DMSO)以及對核酸進(jìn)行預(yù)變性以減少變性后引起的假陽性結(jié)果。
1、 DMSO是將反應(yīng)體系中加入質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%濃度的 DMSO作為保護(hù)劑,其可防止 DNA及 RNA在反應(yīng)中變性和降解;
2、預(yù)變性是指將反應(yīng)體系中的樣品進(jìn)行適當(dāng)緩沖溶液處理以防止樣品變性,從而提高 PCR擴(kuò)增效率。預(yù)變性步驟一般可在2-8℃進(jìn)行。
五、試劑、樣本前處理與后處理
常用的試劑包括:
DNA/RNA (通用試劑):常用的 DNA擴(kuò)增試劑,例如 Taq酶酶切探針、 dNTP裂解探針等。
酶:酶法 PCR的擴(kuò)增效率取決于所用的酶種類及濃度,因此在擴(kuò)增過程中可能需要更換不同的酶。
其他試劑:常規(guī) PCR使用的核酸提取、檢測所需引物,引物及探針等均需要進(jìn)行制備與優(yōu)化; PCR所需核酸片段(探針),如 DNA片段、DNA-RNA等也需要進(jìn)行后處理,以保證在 PCR擴(kuò)增過程中能夠達(dá)到要求。
常見實驗樣品有血細(xì)胞(血小板等)、腦脊液(細(xì)胞和組織)、血清(白蛋白等)及各種生物組織(肌肉和結(jié)締組織等)。
常見實驗項目有血清分析:血清蛋白定量檢測、抗體定量檢測和全血分析;細(xì)胞分析:組織活檢和細(xì)胞學(xué)檢驗;生物樣本:基因芯片研究與分析。
六、核酸提取方法與步驟(包括但不限于提取 DNA等)
提取核酸需要先將基因組 DNA溶解,然后再進(jìn)行下一步處理。
目前常用的方法有以下幾種:
1、核酸酶法:利用特酶切反應(yīng),將核酸直接從 DNA模板上切割下來,得到目標(biāo)產(chǎn)物。常見的有 Taq酶、 DNA聚合酶、 RNase。
2、核酸雜交法:利用特雜交反應(yīng),將目的基因轉(zhuǎn)化到靶基因的表達(dá)上去;
3、原位雜交法:利用組織、細(xì)胞或其他微生物的 DNA作為探針,在靶細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行原位檢測;
4、毛細(xì)管電泳法:利用毛細(xì)管電泳和核酸擴(kuò)增反應(yīng)相結(jié)合,對靶組織和細(xì)胞進(jìn)行標(biāo)記。
以上都是針對傳統(tǒng)方法存在的問題, PCR實驗室檢測可以根據(jù)實際情況使用相應(yīng)的方法,提高檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。
七、檢測儀器與設(shè)備
PCR檢測儀器與設(shè)備主要有以下幾種:
全自動恒溫擴(kuò)增儀:
實時熒光定量 PCR儀:
熒光分光光度計:
電子擴(kuò)增儀或毛細(xì)管電泳式自動進(jìn)樣器,具有擴(kuò)增效率高、反應(yīng)時間短和檢測范圍廣等優(yōu)點。
液相色譜儀:
液相色譜是一種專門用于分離提純和質(zhì)量控制的小型分析儀器,具有檢測靈敏度高、線性范圍寬、穩(wěn)定性好等優(yōu)點。
詞條
詞條說明
吉林白山口罩類衛(wèi)生用品檢測第三方機(jī)構(gòu)
“一次性衛(wèi)生用品檢測”是一種新興的第三方檢測服務(wù),為消費(fèi)者提供了一個安全、科學(xué)、客觀的檢驗依據(jù),具有法律效力。 隨著人們生活水平的提高以及環(huán)境污染的加劇,一次性衛(wèi)生用品檢測市場越來越大。 但由于缺乏相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)和法規(guī),致使市面上大量產(chǎn)品魚龍混雜。 因此一次性衛(wèi)生用品質(zhì)量良莠不齊,嚴(yán)重影響了消費(fèi)者健康和社會安全。 為了**消費(fèi)者健康和安全,有效地保護(hù)消費(fèi)者在使用中的身體健康,加強(qiáng)對產(chǎn)品中不符合標(biāo)準(zhǔn)或質(zhì)
在化妝品市場中,以水溶性為主要特征,具有良好穩(wěn)定性和安全性的潤膚品,是化妝品產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要推動力。我國生產(chǎn)和銷售的化妝品,大多數(shù)屬于**成分,具有安全、**、無刺激、舒適、保濕等特點,適用于任何年齡人群使用。隨著生活水平的提高,越來越多人對護(hù)膚品有了較高要求,市場上的護(hù)膚品種類繁多,功能各異,不僅在使用上有很好的效果,而且對于消費(fèi)者的身體健康也起到了一定的影響。今天我們就來介紹一下化妝品檢測項目
無菌病房是中較為關(guān)鍵的區(qū)域之一,因為它們直接關(guān)系到患者的健康和生命。無菌病房檢測項目是無菌病房環(huán)境管理的重要組成部分,它們直接關(guān)系到無菌病房的潔凈度和衛(wèi)生狀況。本文將重點介紹無菌病房檢測項目,包括溫濕度、照度、噪聲、靜壓差、換氣次數(shù)、沉降菌和浮游菌等方面。 1、溫濕度檢測 溫濕度是無菌病房環(huán)境中需要關(guān)注的重要指標(biāo)。溫度和濕度的變化可能會影響無菌病房的潔凈度和衛(wèi)生狀況,甚至?xí)颊叩慕】诞a(chǎn)生影響。
女生常用的護(hù)膚品有哪些這幾種護(hù)膚品不可或缺 ?女生在化妝時候是一定要卸妝的,因此就需要化妝水的幫助,不卸妝的話對皮膚會有很大的影響,而用化妝水卸妝可以很好的避免各種皮膚問題,避免由于彩妝堆積而引起毛孔堵塞。 潔面乳、爽膚水 相信女生所有的護(hù)膚品里面一定會有這兩款產(chǎn)品,是日常生活中**的護(hù)膚品之一。女生在化妝前的清潔也離不開這兩款產(chǎn)品的幫助。首先就需要用到潔面乳的清洗面部,洗完之后可
公司名: 山東中安生物安全檢測有限公司
聯(lián)系人: 付延兵
電 話:
手 機(jī): 13176668664
微 信: 13176668664
地 址: 山東濟(jì)南章丘市明水經(jīng)濟(jì)開發(fā)區(qū)工業(yè)一路2717號
郵 編:
網(wǎng) 址: sdza666.b2b168.com
公司名: 山東中安生物安全檢測有限公司
聯(lián)系人: 付延兵
手 機(jī): 13176668664
電 話:
地 址: 山東濟(jì)南章丘市明水經(jīng)濟(jì)開發(fā)區(qū)工業(yè)一路2717號
郵 編:
網(wǎng) 址: sdza666.b2b168.com