ChromasPro DNA序列分析軟件介紹


    ChromasPro適用于DNA序列組裝項(xiàng)目,可達(dá)到幾兆字節(jié),并進(jìn)行基本序列編輯和分析。它能夠從Sanger序列器,比如ABI454Illumina下一代序列器中組裝數(shù)據(jù),如果有8GB的可用內(nèi)存,則較多可組裝1,000,000個(gè)序列。







    ChromasPro具體功能:


    打開Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和純文本格式中的序列。

    以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。

    使用圖形界面組裝重疊序列,生成一致性并**模糊性進(jìn)行編輯。

    使用高質(zhì)量數(shù)據(jù)自動(dòng)去除低質(zhì)量序列以改進(jìn)序列組裝。

    使用參考序列作為組裝的支架。

    生成限制位點(diǎn)和片段圖,并列出切割,非切割和片段。

    映射開放閱讀框,由G+C框架圖輔助,并用一次點(diǎn)擊翻譯ORFs。

    打印色譜圖,限制位點(diǎn)和片段圖,和開放閱讀框架圖。

    通過NCBI網(wǎng)站進(jìn)行核苷酸和蛋白質(zhì)BLAST搜索。

    與ClustalW接口執(zhí)行多個(gè)對(duì)齊。

    反向互補(bǔ)序列和色譜圖。

    通過精確匹配或較優(yōu)對(duì)齊搜索序列。

    編輯核苷酸序列時(shí)顯示翻譯。

    進(jìn)行反向翻譯并繪制核苷酸簡并。

    繪制蛋白質(zhì)的親水性和抗原性。

    復(fù)制色譜切片的圖像,粘貼到文檔或演示文稿中。

     

    系統(tǒng)需求

    Compatible with Windows 7sp1, 8, 10.


    北京天演融智軟件有限公司(科學(xué)軟件網(wǎng))是 ChromasPro 軟件在中國的授權(quán)經(jīng)銷商,為中國的 ChromasPro 軟件用戶提供優(yōu)質(zhì)的軟件銷售和培訓(xùn)服務(wù)。


    北京天演融智軟件有限公司專注于matlab,stata,spsspro,pscad,gams,nvivo,cyme,gms,mathematica等

  • 詞條

    詞條說明

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