兩個(gè)吸血鬼走進(jìn)酒吧并叫來酒保
"給我來杯血",一個(gè)吸血鬼說。
"給我來杯血漿",另一個(gè)吸血鬼說。
"好的"酒?;卮?,"一杯血和一杯軟血(Blood lite)!"
(此處應(yīng)該有笑聲)
是的,我們?cè)趹c祝一個(gè)恐怖的季節(jié),同時(shí),也在此發(fā)布我們的新產(chǎn)品PowerMag Blood DNA/RNA Isolation kit。
血液:里面有什么?
血液中含有血漿、紅細(xì)胞、白細(xì)胞和血小板,它是非常*特的一種樣品,因?yàn)檠褐械暮怂岱浅XS富,這座基因金礦被掩埋在各種的細(xì)胞碎片和蛋白混合物中,這些污染物會(huì)影響下游的PCR反應(yīng)或測序,尤其是紅細(xì)胞里的血紅蛋白,它是影響DNA/RNA純度和抑制PCR反應(yīng)的主要元兇。
血液的采集和保存
應(yīng)該用抗凝管采集血液,否則血液凝集并把攜帶DNA/RNA的細(xì)胞都包埋起來。。常見準(zhǔn)的血液采集管會(huì)使用EDTA或檸檬酸鹽抗凝。這兩種物質(zhì)都不會(huì)干擾下游的基因分析。肝素也能抗凝,但它容易吸附DNA,所以不推薦。
如果不能馬上處理,用于DNA提取的全血可以在4度較長保存2個(gè)星期,用于RNA提取的較長不**過2個(gè)小時(shí)。如果需要保存較長時(shí)間,則要做一些特殊處理了。如果只需要DNA,你可以將血液分裝成小份(250-500 μL)置于-20oC 或-80oC 長時(shí)間保存。 若要提取血液中的RNA,就需要當(dāng)心了。RNA酶是一種很頑強(qiáng)的酶,即便在冷凍狀態(tài)下仍能發(fā)揮作用,如果不能馬上處理樣本,我們建議將血樣置于到RNA穩(wěn)定液中,比如PAXgene?血液RNA管。在這些管子里頭,胞RNA在18°C到25°C可穩(wěn)定保存3天,2°C到8°C可保存5天。
另一方面,如果RNA中途要暫停,可把分離、裂解、凍存步驟沉淀的白細(xì)胞置于RNA酶抑制緩沖液中。例如,沉淀的白細(xì)胞可以置于PowerMag? Blood DNA/RNA Isolation kit所帶的PowerMag? 白細(xì)胞裂解液中,-20oC 或 -80oC保存,當(dāng)你做好提取準(zhǔn)備時(shí),將樣品取出放在室溫,照接下來的步驟操作即可。
從血液中獲得DNA或RNA
在PowerMag Blood DNA/RNA Isolation kit 中,利用了哺乳動(dòng)物血液中,基因組DNA(gDNA)只存在于白細(xì)胞中,紅細(xì)胞和血小板中沒有核酸所以不含gDNA(禽類紅細(xì)胞例外)的特性,紅細(xì)胞或白細(xì)胞靠緩沖液來裂解。一般來講,1ml人血中白細(xì)胞的平均數(shù)大概7,000,000個(gè)。
操作的第一步是用低滲緩沖液選擇性的裂解紅細(xì)胞。然后沉淀白細(xì)胞,去除上清中含有亞鐵血紅素的紅細(xì)胞。。往白細(xì)胞沉淀中加入裂解緩沖液以釋放核酸,像上面說到的,如果要提取RNA而又不能立馬處理,此處是可以將其放在(-20℃ 或-80 ℃)長期保存的時(shí)機(jī),接下來使用ClearMag? 磁珠特異性捕獲核酸,去除雜質(zhì),再洗滌核酸,最后洗脫的核酸可直接用于下游反應(yīng)。
RNA和DNA的平均得率?
沒有兩個(gè)血液樣本是一樣的。白細(xì)胞數(shù)量的不同會(huì)影響到提取的核酸的量,而白細(xì)胞數(shù)量會(huì)受采樣時(shí)宿主的健康狀況影響。不同種屬動(dòng)物血液的核酸提**率也不一樣。然而,每200ml MO BIO員工全血的DNA和RNA平均提**率分別是3mg和1mg。
高分子量的核酸
如果你要用高通量的方法從血液中提取高分子量的核酸,這款試劑盒再合適不過了!我們已經(jīng)用這款試劑盒提取到了高達(dá)100kb的DNA片段,如果你在尋找那些含量不高但片段很長的靶DNA以用于測序,使用這款血液試劑盒吧!
說了這么多,實(shí)在餓了,我較好回到餐桌那去,我的水和大蒜們都在等我呢,萬圣節(jié)后見!
參考文獻(xiàn):
1. Yokota M, Tatsumi N, Nathalang O, Yamada T, Tsuda I. (1999). "Effects of Heparin on Polymerase Chain Reaction for Blood White Cells". J. Clin. Lab. Anal. 13: 133–140.
2. DNA isolation by a rapid method from human blood samples: effects of MgCl2, EDTA, storage time, and temperature on DNA yield and quality. Lahiri DK1, Schnabel B. Biochem Genet. 1993 Aug;31(7-8):321-8.
詞條
詞條說明
來源:深圳市安必勝科技有限公司 轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處 MOBIO較近新發(fā)布了產(chǎn)品,PowerMicrobiome RNA Kit 和PowerMag Microbiome RNA/DNA Isolation Kit,隨之而來有非常多關(guān)于糞便DNA和RNA提取方面的咨詢。其中較常問到的是,糞便樣品在進(jìn)一步處理前應(yīng)如何儲(chǔ)藏運(yùn)輸。 我詢問了人類糞便/腸內(nèi)容物方面的*Dr. Rob Knight。Dr. K
? ?? 你也在考慮高通量提取DNA/RNA嗎?很多在用我們MOBIO單管提取試劑盒的客戶希望擴(kuò)大樣本通量。我們也收到了很多客戶咨詢,例如高通量提取需要換用什么設(shè)備?提高通量意味著要將2ml單管替換成96孔板。盡管很多客戶已有使用96孔板的經(jīng)驗(yàn),但大多數(shù)從來沒96孔板上的珠磨研磨。 絕 ? ?大部分MO BIO的試劑盒利用了珠磨研磨技術(shù)來幫助裂解細(xì)
來源:深圳市安必勝科技有限公司 轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處【字號(hào):大 中 小】 當(dāng)提到從各種樣品中提取DNA或RNA,較快速徹底的樣品處理辦法就要數(shù)研磨珠高速擊打破碎。無論研磨均質(zhì)微生物、老鼠組織、植物種子或葉子,還是各種土壤,使用研磨珠都能有效打破細(xì)胞壁和細(xì)胞膜,釋放出DNA、RNA,供下游提取純化。 目前市場上有大量各種類型研磨珠供選擇,使用者往往無從下手。本文總結(jié)歸納了在MoBio實(shí)驗(yàn)室使用的各種研磨
作者:Michelle Tetreault Carlson 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號(hào):大 中 小】 歡迎回來!我們將繼續(xù)回來與大家一起分享一些新穎的不一樣的想法。分享一些客戶常問的技術(shù)問題,以及我們的回答??茖W(xué)家們提出了使用我們產(chǎn)品過程中遇到的問題,我們給與了回答,還有什么比這個(gè)較節(jié)省您的時(shí)間? 這周我們我們討論:為什么用酒精作為防腐劑保存環(huán)境樣品不是個(gè)好主意? 問:我們想用PowerS
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