磁珠法血液DNA/RNA的高通量提取

    作者:Michelle Tetreault Carlson 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號(hào):大 中 小】

    兩個(gè)吸血鬼走進(jìn)酒吧并叫來酒保

    "給我來杯血",一個(gè)吸血鬼說。

    "給我來杯血漿",另一個(gè)吸血鬼說。

    "好的"酒?;卮?,"一杯血和一杯軟血(Blood lite)!"

    (此處應(yīng)該有笑聲)

    是的,我們?cè)趹c祝一個(gè)恐怖的季節(jié),同時(shí),也在此發(fā)布我們的新產(chǎn)品PowerMag Blood DNA/RNA Isolation kit。

    血液:里面有什么?

    血液中含有血漿、紅細(xì)胞、白細(xì)胞和血小板,它是非常*特的一種樣品,因?yàn)檠褐械暮怂岱浅XS富,這座基因金礦被掩埋在各種的細(xì)胞碎片和蛋白混合物中,這些污染物會(huì)影響下游的PCR反應(yīng)或測序,尤其是紅細(xì)胞里的血紅蛋白,它是影響DNA/RNA純度和抑制PCR反應(yīng)的主要元兇。

    血液的采集和保存

    應(yīng)該用抗凝管采集血液,否則血液凝集并把攜帶DNA/RNA的細(xì)胞都包埋起來。。常見準(zhǔn)的血液采集管會(huì)使用EDTA或檸檬酸鹽抗凝。這兩種物質(zhì)都不會(huì)干擾下游的基因分析。肝素也能抗凝,但它容易吸附DNA,所以不推薦。

    如果不能馬上處理,用于DNA提取的全血可以在4度較長保存2個(gè)星期,用于RNA提取的較長不**過2個(gè)小時(shí)。如果需要保存較長時(shí)間,則要做一些特殊處理了。如果只需要DNA,你可以將血液分裝成小份(250-500 μL)置于-20oC 或-80oC 長時(shí)間保存。 若要提取血液中的RNA,就需要當(dāng)心了。RNA酶是一種很頑強(qiáng)的酶,即便在冷凍狀態(tài)下仍能發(fā)揮作用,如果不能馬上處理樣本,我們建議將血樣置于到RNA穩(wěn)定液中,比如PAXgene?血液RNA管。在這些管子里頭,胞RNA在18°C到25°C可穩(wěn)定保存3天,2°C到8°C可保存5天。

    另一方面,如果RNA中途要暫停,可把分離、裂解、凍存步驟沉淀的白細(xì)胞置于RNA酶抑制緩沖液中。例如,沉淀的白細(xì)胞可以置于PowerMag? Blood DNA/RNA Isolation kit所帶的PowerMag? 白細(xì)胞裂解液中,-20oC 或 -80oC保存,當(dāng)你做好提取準(zhǔn)備時(shí),將樣品取出放在室溫,照接下來的步驟操作即可。

    從血液中獲得DNA或RNA

    在PowerMag Blood DNA/RNA Isolation kit 中,利用了哺乳動(dòng)物血液中,基因組DNA(gDNA)只存在于白細(xì)胞中,紅細(xì)胞和血小板中沒有核酸所以不含gDNA(禽類紅細(xì)胞例外)的特性,紅細(xì)胞或白細(xì)胞靠緩沖液來裂解。一般來講,1ml人血中白細(xì)胞的平均數(shù)大概7,000,000個(gè)。

    操作的第一步是用低滲緩沖液選擇性的裂解紅細(xì)胞。然后沉淀白細(xì)胞,去除上清中含有亞鐵血紅素的紅細(xì)胞。。往白細(xì)胞沉淀中加入裂解緩沖液以釋放核酸,像上面說到的,如果要提取RNA而又不能立馬處理,此處是可以將其放在(-20℃ 或-80 ℃)長期保存的時(shí)機(jī),接下來使用ClearMag? 磁珠特異性捕獲核酸,去除雜質(zhì),再洗滌核酸,最后洗脫的核酸可直接用于下游反應(yīng)。

    RNA和DNA的平均得率?

    沒有兩個(gè)血液樣本是一樣的。白細(xì)胞數(shù)量的不同會(huì)影響到提取的核酸的量,而白細(xì)胞數(shù)量會(huì)受采樣時(shí)宿主的健康狀況影響。不同種屬動(dòng)物血液的核酸提**率也不一樣。然而,每200ml MO BIO員工全血的DNA和RNA平均提**率分別是3mg和1mg。

    高分子量的核酸

    如果你要用高通量的方法從血液中提取高分子量的核酸,這款試劑盒再合適不過了!我們已經(jīng)用這款試劑盒提取到了高達(dá)100kb的DNA片段,如果你在尋找那些含量不高但片段很長的靶DNA以用于測序,使用這款血液試劑盒吧!

    說了這么多,實(shí)在餓了,我較好回到餐桌那去,我的水和大蒜們都在等我呢,萬圣節(jié)后見!

    參考文獻(xiàn):

    1. Yokota M, Tatsumi N, Nathalang O, Yamada T, Tsuda I. (1999). "Effects of Heparin on Polymerase Chain Reaction for Blood White Cells". J. Clin. Lab. Anal. 13: 133–140.

    2. DNA isolation by a rapid method from human blood samples: effects of MgCl2, EDTA, storage time, and temperature on DNA yield and quality. Lahiri DK1, Schnabel B. Biochem Genet. 1993 Aug;31(7-8):321-8.


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