MO BIO技術(shù)部:
我在使用RNA Power Soil Total RNA Isolation kit處理一些高鹽含量的土壤樣品,結(jié)果提取出來(lái)的全是DNA而不是RNA,這是怎么回事呢?
Thao:
您好!
提取含鹽量高的土壤或其它類(lèi)型樣品需要些技巧。RNA PowerSoil Total RNA Isolation kit(貨號(hào):12866-25)使用的是陰離子交換樹(shù)脂來(lái)吸附和洗滌核酸。在低鹽條件下,帶負(fù)電荷的RNA/DNA被牢牢吸附綁定在帶正電荷的樹(shù)脂上。高鹽條件下,它們彼此的極性會(huì)被掩蓋。通過(guò)調(diào)節(jié)離心柱所使用緩沖液的鹽濃度可控制RNA或DNA的洗脫。逐漸提高鹽濃度的過(guò)程中,先洗脫下來(lái)的是RNA,然后洗脫DNA。然而,如果處理的是高鹽含量的土樣,會(huì)改變樹(shù)脂所處的緩沖環(huán)境,這就是你現(xiàn)在面臨的狀況。土樣中殘留的過(guò)高鹽分導(dǎo)致較終洗脫下來(lái)的是DNA而非RNA。
為了去除這些起干擾作用的鹽份,可以對(duì)土樣進(jìn)行洗滌。把樣品加入到15ml滅菌收集管中,再加入10ml滅菌PBS,短暫渦旋混勻,10,000 x g離心2min,棄上清。這樣重復(fù)洗滌3次,效果會(huì)好很多。
祝好!
MO BIO 技術(shù)
附
金屬含量高的土樣也會(huì)影響試劑盒的提取效果,我們建議使用滅菌的TE緩沖液(10 mM Tris, 1 mM EDTA)對(duì)這種類(lèi)型的土壤進(jìn)行重復(fù)洗滌。在此,EDTA可起到螯合金屬離子的作用。操作同上,將TE緩沖液和樣品都加入到收集管內(nèi),渦旋混勻,然后離心沉淀細(xì)胞和土壤顆粒,棄去上清,根據(jù)實(shí)際需要可以多洗幾遍。
詞條
詞條說(shuō)明
來(lái)源:深圳市安必勝科技有限公司 轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處 MOBIO的技術(shù)團(tuán)隊(duì)參加了芝加哥舉行的*四屆阿爾貢土壤宏基因組學(xué)會(huì)議,其中較熱的話題就是絲狀真菌。技術(shù)部的熱線響個(gè)不停,來(lái)電有許多咨詢?nèi)绾翁崛〗z狀真菌DNA和RNA,貌似全宇宙都在關(guān)心絲狀真菌。所以很值得在技術(shù)文章里頭占一篇只之地。 真菌是種很有趣的微生物。有哪個(gè)物種的大小既能是一個(gè)細(xì)胞,也能長(zhǎng)到迄今為止已知地球上較大的生物體,足足占地4平方英里(
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