探索地下微生物世界：尋找新的抗生素

時(shí)間：2020-01-05作者：深圳市安必勝科技有限公司瀏覽：592

作者：Suzanne kennedy 來源：美國MoBio實(shí)驗(yàn)室

這個(gè)月我們采訪了明尼蘇達(dá)州州立大學(xué)藥物設(shè)計(jì)中心副教授Dr. Christine Salomon。
Dr. Salomon專注于化學(xué)與微生物生態(tài)學(xué)交叉領(lǐng)域，尋找具有長遠(yuǎn)開發(fā)應(yīng)用潛力的新發(fā)現(xiàn)代謝產(chǎn)物。當(dāng)花費(fèi)大量經(jīng)歷研究地球表面生物，我們對地底下的生物世界卻知之甚少。Dr. Salomon調(diào)查研究了位于明尼蘇達(dá)州北邊的蘇丹礦山深入地下半英里的神秘微生物群。蘇丹礦山這個(gè)廢棄的鐵礦，已經(jīng)劃入了明尼蘇達(dá)州州立公園，成為新的待開發(fā)研究資源。

問：蘇丹礦山下的微生物生態(tài)與其它地下洞穴有什么不同？

答：當(dāng)?shù)V山還開采的時(shí)候，礦工就打了大量的探孔尋找更多的鐵礦。隨著時(shí)間推移，地下水從周圍巖石通過探孔滲透到礦洞中，形成富鐵鹵水。進(jìn)入礦洞后開始接觸含氧空氣并混入大量氯化鈣。前期采樣做微生物多樣性分析發(fā)現(xiàn)大量放線菌基因。而這種革蘭氏陽性菌正是生產(chǎn)多種抗生素和更多有趣物質(zhì)的來源。

問：你們的實(shí)驗(yàn)室對這些微生物群落做了怎樣的調(diào)查？

答：去年夏天我們收到LCCMR 從環(huán)境與自然資源信托基金的撥款，培養(yǎng)從礦洞中收集到的樣品，并從這些菌株中發(fā)現(xiàn)了一些新的代謝產(chǎn)物。有趣的是，蘇丹礦山發(fā)現(xiàn)的大量放線菌種類非常接近于海底泥微生物。同時(shí)也發(fā)現(xiàn)這些微生物能夠生產(chǎn)出一些*一**的抗真菌組分。

問：做這些工作的意義有哪些？下一步有什么計(jì)劃？

答：目前*理想的抗真菌感染藥物種類非常有限，所以尋找新的抗真菌組分變得非常熱門。我們對這些新穎的代謝產(chǎn)物非常感興趣，希望開發(fā)出可用于人類疾病**的產(chǎn)品。同時(shí)，我們對蘇丹礦山中真菌與細(xì)菌之間的化學(xué)生態(tài)關(guān)系也非常感興趣。正與一位真菌微生物學(xué)家合作，準(zhǔn)備再次進(jìn)洞收集真菌樣品，研究其在礦洞環(huán)境下與其它微生物之間的微妙共生關(guān)系中扮演的角色。

問：Mo BIO的產(chǎn)品如何助力你的工作？

答：我們使用PowerSoil Kit來提取樣品微生物DNA并建立克隆庫。也用了BiOstic Bacteremia kit提取培養(yǎng)的放線菌DNA。試劑盒自帶的研磨珠裂解革蘭氏陽性菌非常高效，相對于傳統(tǒng)基因組DNA提取方法節(jié)省了大量處理時(shí)間。

 


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