使用蒙特卡羅模擬計(jì)算功率,*1部分: 基礎(chǔ)知識

    功率和樣本大小的計(jì)算是科學(xué)研究計(jì)劃的重要組成部分??梢允褂肧tata的power命令來計(jì)算許多常用統(tǒng)計(jì)測試的功率和樣本大小需求。但對于較復(fù)雜的模型是沒有簡單公式的,如多層/縱向模型和結(jié)構(gòu)方程模型(SEMs)。蒙特卡羅模擬是計(jì)算復(fù)雜模型的功率和樣本大小要求的一種方法,Stata提供了執(zhí)行此操作所需要的所有工具。甚至可以將模擬集成到Stata的power命令中,可以輕松地為一系列參數(shù)值創(chuàng)建自定義表格和圖形。


    比如,下面的自定義程序power simmixed模擬縱向模型的功率,假設(shè)參與者的數(shù)量(級別2)為100到500,每次增加100,每個參與者有5到6個觀察值(級別1)。power simmixed還創(chuàng)建了一個表(未顯示)和下圖來顯示模擬的結(jié)果。


    我的同事和我寫了一系列文章展示如何做到這一點(diǎn)。在今天的文章中,將介紹使用模擬計(jì)算功率和樣本大小要求所需的基本工具。在*二篇文章中,將展示如何將模擬集成到Stata的power命令中。 然后,我們將展示線性回歸,邏輯回歸,多級/縱向模型和結(jié)構(gòu)方程模型的具體示例。

    基本思路

    統(tǒng)計(jì)功率是當(dāng)零假設(shè)為假時拒絕零假設(shè)的概率。功率的計(jì)算是基于一組假設(shè),例如樣本大小,alpha水平和特定的替代假設(shè)。例如,我們可能希望計(jì)算t檢驗(yàn)的功率,假設(shè)零假設(shè)的樣本均值為70,替代假設(shè)為75,樣本大小為100,alpha水平為0.05。

    使用蒙特卡羅模擬計(jì)算功率的基本步驟是

    1. 生成假設(shè)替代假設(shè)為真(例如,均值=75)的數(shù)據(jù)集。

    2. 使用數(shù)據(jù)集測試零假設(shè)(例如,測試均值= 70)。

    3. 保存測試結(jié)果(例如,“拒絕”或“未拒絕”)。

    4. 多次重復(fù)步驟1-3(通常為1,000或更多)。

    零假設(shè)被拒絕的比例是我們對統(tǒng)計(jì)能力的估算。在上面的例子中,我們可能在1000次迭代中觀察到834次“拒絕”,這使我們的估算功率為0.834或83.4%。

    要執(zhí)行這些步驟,需要熟悉Stata的一些編程工具。以下是本文中介紹的主題列表。 如果您熟悉其中一些主題,可以單擊下面的鏈接跳到不熟悉的主題。

    主題列表

    標(biāo)量和局部宏

    創(chuàng)建偽隨機(jī)數(shù)據(jù)集

    存儲模型輸出

    如何使用程序創(chuàng)建簡單程序

    如何使用程序創(chuàng)建有用的程序

    如何使用模擬多次運(yùn)行程序

    用power onemean來檢查結(jié)果

    標(biāo)量和局部宏

    標(biāo)量和本地宏是模擬的重要工具,因?yàn)樗鼈冊试S將數(shù)字臨時存儲在內(nèi)存中。例如,可以通過輸入將數(shù)字1存儲到名為i的標(biāo)量中


    稍后通過輸入來引用此標(biāo)量



    如果對標(biāo)量和變量使用相同的名稱,Stata將會變得混亂??梢酝ㄟ^為標(biāo)量使用一的名稱來避免這種混淆,或者可以使用scalar()函數(shù)來引用標(biāo)量。


    還可以使用本地宏存儲數(shù)字。 例如,可以通過輸入將數(shù)字1存儲到名為i的本地宏。



    然后,可以通過在其**引用左單引號(通常位于“1”鍵左側(cè)的鍵盤上)并使用右單引號(通常位于Enter鍵左側(cè))來引用本地宏。)。


    本地宏通常用于定義模擬的輸入?yún)?shù),許多Stata命令的結(jié)果存儲為標(biāo)量。

    創(chuàng)建偽隨機(jī)數(shù)據(jù)集

    您還需要生成隨機(jī)數(shù)來進(jìn)行模擬。在這里,將展示一些常用的隨機(jī)數(shù)函數(shù),并參考Stata Functions Reference Manual以獲取完整列表。首先清除Stata的內(nèi)存,將隨機(jī)數(shù)種子設(shè)置為15,然后使用set obs告訴Stata我們想要創(chuàng)建一個包含200個觀察值的數(shù)據(jù)集。


    可以使用runiform()函數(shù)在區(qū)間(0,1)內(nèi)生成均勻分布的隨機(jī)數(shù)。


    可以使用類似的runiformint(a,b)函數(shù)在區(qū)間[a,b]上生成均勻分布的隨機(jī)整數(shù)變量。例如,可以輸入以下命令,在區(qū)間[18,65]內(nèi)生成一個人的年齡的隨機(jī)值:


    可以使用rbinomial(n,p)函數(shù)生成二項(xiàng)式(n,p)隨機(jī)變量,其中n是試驗(yàn)次數(shù),p是成功概率。例如,可以通過輸入以下命令為女性生成隨機(jī)指示器:



    還可以使用rnormal(m,s)函數(shù)從正常密度生成隨機(jī)值,其中均值等于m,標(biāo)準(zhǔn)差等于s。 例如,可以使用以下命令生成重量和高度的變量。在這里,*了72千克的平均值和15的標(biāo)準(zhǔn)偏差,以及170厘米的平均值和10的標(biāo)準(zhǔn)偏差。


    在這個例子中,我們獨(dú)立地生成了weight和height。但是像weight和height這樣的變量很可能是相關(guān)的,可以使用drawnorm來生成相關(guān)的變量。

    在下面的示例中,平均值存儲在矩陣m中,標(biāo)準(zhǔn)偏差存儲在矩陣s中,矩陣C中存儲變量之間的相關(guān)性。然后,可以將這些矩陣作為參數(shù)包含在drawingorm選項(xiàng)中以創(chuàng)建相關(guān)變量height和weight.。



    上述均值和標(biāo)準(zhǔn)差的估算值與我們的輸入?yún)?shù)相似,下面的估算相關(guān)系數(shù)為0.5049,接近我們在上面的相關(guān)矩陣中*的0.5的值。


    存儲模型輸出

    許多Stata命令將其結(jié)果存儲為標(biāo)量,宏和矩陣。運(yùn)行命令后,可以通過輸入return list查看存儲結(jié)果的列表。還可以在估算命令(如regress)后輸入ereturn list。

    在下面的例子中,我使用ttest命令來測試平均權(quán)重等于70的零假設(shè)。



    輸入return list顯示Stata存儲在內(nèi)存中的標(biāo)量列表。


    上述均值和標(biāo)準(zhǔn)差的估算值與我們的輸入?yún)?shù)相似,下面的估算相關(guān)系數(shù)為0.5049,接近我們在上面的相關(guān)矩陣中*的0.5的值。



    存儲輸出模型

    許多Stata命令將其結(jié)果存儲為標(biāo)量,宏和矩陣。運(yùn)行命令后,可以通過輸入return list查看存儲結(jié)果的列表。還可以在估算命令(如regress)后鍵入ereturn list。

    在下面的示例中,我使用ttest命令來測試平均權(quán)重等于70的零假設(shè)。


    輸入return list會顯示Stata存儲在內(nèi)存中的標(biāo)量列表。



    可以將這些標(biāo)量中的任意一個存儲到另一個標(biāo)量中。例如,可以通過輸入將存儲在r(p)中的雙面p值存儲到名為pvalue的標(biāo)量中


    如何使用程序創(chuàng)建一個簡單的程序

    您將運(yùn)行生成隨機(jī)數(shù)據(jù)的命令,并在運(yùn)行模擬時多次測試零假設(shè)。還需要為模擬定義輸入?yún)?shù)并返回假設(shè)檢驗(yàn)的結(jié)果。有效地完成這些任務(wù)的一種方法是使用program定義自己的Stata程序。下面的代碼塊定義了一個名為myprogram的程序,它接受輸入?yún)?shù)n(),顯示n的值,并返回n的值。


    讓我們逐行考慮這個代碼塊。

    **行是capture program drop myprogram。定義程序后,必須先使用program drop將程序從內(nèi)存中刪除,然后才能修改和重新定義程序。因?yàn)楹芸赡茉谕瓿芍皶啻涡薷拇顺绦?,所以在重新定義程序之前,它將節(jié)省運(yùn)行program drop的時間。**次運(yùn)行此代碼塊時不會定義程序,所以program drop將返回一個錯誤。在program drop之前輸入capture將捕獲此錯誤并允許代碼塊繼續(xù)運(yùn)行。

    *二行是程序program myprogram, rclass。 開始定義程序myprogram。 定義程序后,可以輸入myprogram,Stata將在program和end之間運(yùn)行所有命令。選項(xiàng)rclass告訴Stata我們想要使用return返回程序中的值。

    *三行,15.1版本告訴Stata希望使用Stata 15.1中編寫的功能來運(yùn)行程序。 可以在Stata Programming Reference Manual中了解有關(guān)Stata版本控制的更多信息。

    *四行是syntax, n(integer)。 定義了程序的語法。該程序要求用戶輸入逗號,后跟n()的整數(shù)。n()的值存儲在名為n的本地宏中,可以將此本地宏稱為“n”。

    *五行顯示本地宏n的值。

    *六行是return scalar N = `n’。此行指示程序以名為N的標(biāo)量形式返回n的值。
    最后一行是end。這告訴Stata你已經(jīng)完成了程序myprogram的定義。

    讓我們運(yùn)行myprogram,看看它做了什么。


    為n()輸入值50,Stata顯示結(jié)果n = 50。
    可以輸入return list,并看到myprogram以標(biāo)量r(N)的形式返回n的值。


    非常有用!

    如何使用程序創(chuàng)建有用的程序

    讓我們定義一個名為simttest的程序,它根據(jù)輸入?yún)?shù)生成一個隨機(jī)數(shù)據(jù)集,測試零假設(shè),并返回我們的假設(shè)檢驗(yàn)結(jié)果。 下面的代碼塊僅使用注釋來定義程序。


    現(xiàn)在,讓我們在下面的代碼塊中填寫詳細(xì)信息。


    syntax的定義包括一個必需參數(shù),n()和四個可選參數(shù),alpha(),m0(),ma(),和sd()。 可選參數(shù)包含在方括號中。所有輸入?yún)?shù)都包含對輸入值的限制。例如,n()必須是整數(shù),可選參數(shù)必須是實(shí)數(shù)??蛇x參數(shù)還包括一個默認(rèn)值,如果用戶在輸入程序名稱時未*輸入?yún)?shù),則使用該值。例如,除非用戶*不同的值,否則將為m0分配值0。

    注意,在此示例中,n()是樣本大小,alpha()是alpha級別,m0()是假設(shè)零假設(shè)的平均值,ma()是假設(shè)備選假設(shè)的平均值,sd()是標(biāo)準(zhǔn)偏差。

    然后drawnorm使用輸入?yún)?shù)從均值為`ma’、標(biāo)準(zhǔn)差為`sd’的正態(tài)分布中生成一個觀測值為`n’的樣本。接下來,ttest測試樣本均值等于`m0′的原假設(shè)。

    可以通過輸入return scalar reject =(r(p)<`alpha')來返回假設(shè)檢驗(yàn)的結(jié)果。 回想一下ttest將雙邊p值存儲在標(biāo)量r(p)中。 當(dāng)r(p)小于`alpha’*的alpha級別時,我們的程序使用標(biāo)量拒絕返回值1,否則返回0。

    現(xiàn)在,可以輸入simttest和輸入?yún)?shù)來運(yùn)行模擬。



    通過輸入return list,可以看到模擬的結(jié)果。



    如何使用模擬多次運(yùn)行程序

    simttest程序?qū)?zhí)行模擬的一次迭代所需的所有操作。 接下來,需要一種方法來多次運(yùn)行simttest并收集結(jié)果。下面的代碼塊顯示了如何使用simulate來完成這兩項(xiàng)任務(wù)。


    參數(shù)reject=r(reject)告訴simulate將r(reject)中返回的結(jié)果保存到名為reject的變量中。 選項(xiàng)reps(100)指示模擬運(yùn)行程序100次。 選項(xiàng)seed(12345)設(shè)置隨機(jī)數(shù)種子,以便我們的結(jié)果可以重現(xiàn)。

    冒號之后是simttest以及我們模擬的輸入?yún)?shù)。 某些模擬需要很長時間才能運(yùn)行,并且simulate會在結(jié)果窗口中顯示一個點(diǎn),以便知道它仍在運(yùn)行。下面的輸出顯示了我們的模擬結(jié)果。



    simulate將結(jié)果保存到變量reject,如果零假設(shè)的測試被拒絕則包含1,否則為0。


    可以使用summarize來計(jì)算reject的平均值,該平均值等于100次迭代中拒絕原假設(shè)的次數(shù)所占的比例。根據(jù)輸入?yún)?shù),該比例是對統(tǒng)計(jì)功效的估算!



    在這個例子中,比例等于0.91,這意味著當(dāng)檢驗(yàn)樣本平均值等于75的替代假設(shè)時,如果樣本平均值等于70,假設(shè)標(biāo)準(zhǔn)偏差為15且樣本量為100,可以期望91%的功率。

    用Power OneMean檢查結(jié)果

    可以使用power onemean檢查蒙特卡羅模擬的結(jié)果。 以下示例包含與我們的模擬相同的輸入?yún)?shù)。


    power onemean計(jì)算的功率為0.9100,這與我們的模擬估算的功率相同。因?yàn)槟M是隨機(jī)的,所有結(jié)果并不總是**的。改變隨機(jī)數(shù)種子或迭代次數(shù)可以稍微改變估算的功率。但結(jié)果應(yīng)該很接近。

    總結(jié)

    在本文中,介紹了使用蒙特卡羅模擬計(jì)算統(tǒng)計(jì)功率和樣本大小需求所需的工具。 下一次,將向您展示如何使用Stata的power命令來運(yùn)行模擬,以便可以輕松地為一系列輸入?yún)?shù)創(chuàng)建表格和圖形。




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