ChromasPro適用于DNA序列組裝項(xiàng)目,可達(dá)到幾兆字節(jié),并進(jìn)行基本序列編輯和分析。它能夠從Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中組裝數(shù)據(jù),如果有8GB的可用內(nèi)存,則較多可組裝1,000,000個(gè)序列。
ChromasPro具體功能
? 打開(kāi)Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和純文本格式中的序列。
? 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
? 使用圖形界面組裝重疊序列,生成一致性并**模糊性進(jìn)行編輯。
? 使用高質(zhì)量數(shù)據(jù)自動(dòng)去除低質(zhì)量序列以改進(jìn)序列組裝。
? 使用參考序列作為組裝的支架。
? 生成限制位點(diǎn)和片段圖,并列出切割,非切割和片段。
? 映射開(kāi)放閱讀框,由G+C框架圖輔助,并用一次點(diǎn)擊翻譯ORFs。
? 打印色譜圖,限制位點(diǎn)和片段圖,和開(kāi)放閱讀框架圖。
? 通過(guò)NCBI網(wǎng)站進(jìn)行核苷酸和蛋白質(zhì)BLAST搜索。
? 與ClustalW接口執(zhí)行多個(gè)對(duì)齊。
? 反向互補(bǔ)序列和色譜圖。
? 通過(guò)精確匹配或較優(yōu)對(duì)齊搜索序列。
? 編輯核苷酸序列時(shí)顯示翻譯。
? 進(jìn)行反向翻譯并繪制核苷酸簡(jiǎn)并。
? 繪制蛋白質(zhì)的親水性和抗原性。
? 復(fù)制色譜切片的圖像,粘貼到文檔或演示文稿中。
系統(tǒng)需求
Compatible with Windows XP, Vista, 7, 8, 10.
更多詳情請(qǐng)登陸 科學(xué)軟件網(wǎng) 。
詞條
詞條說(shuō)明
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