化石：從考古“廢料”進(jìn)行DNA測(cè)序

時(shí)間：2013-12-18作者：上海億欣生物科技有限公司瀏覽：186

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化石：從考古“廢料”進(jìn)行DNA測(cè)序

本期Scientific Reports雜志上介紹了用于通過(guò)“古DNA”(aDNA)測(cè)序來(lái)分析大塊骨頭樣本內(nèi)單一不明碎片的一個(gè)新的快速方法。骨頭的小碎片常見(jiàn)于考古和古生物挖掘坑中，但會(huì)難以識(shí)別，而單一樣本的aDNA分析也會(huì)是昂貴的和費(fèi)時(shí)的。

Michael Bunce及同事提出一個(gè)被稱為“bulk-bone”的方法。采用該方法，他們從骨頭粉末的混合樣本中提取和放大時(shí)間遠(yuǎn)之距今大約46,000年前的aDNA。每個(gè)樣本含有來(lái)自在澳大利亞兩個(gè)考古點(diǎn)（其名稱分別為Devil’s Lair 和 Tunnel Cave）的15個(gè)沉積層之一內(nèi)所發(fā)現(xiàn)的50-150個(gè)化石碎片的材料。他們對(duì)提取的aDNA進(jìn)行篩選，以尋找可放大的線粒體DNA，后者隨后采用高吞吐量測(cè)序方法（一種“元條碼”方法）進(jìn)行測(cè)序。然后，作者完成了一項(xiàng)分類分析，它表明這些樣本含有來(lái)自一系列哺乳動(dòng)物、鳥(niǎo)類和爬行類的DNA。

對(duì)來(lái)自發(fā)掘點(diǎn)和測(cè)試坑的大塊骨頭樣本進(jìn)行快速的、高性價(jià)比的分析，同時(shí)又不會(huì)損壞在形態(tài)上重要的樣本，這種方法對(duì)考古學(xué)家和古生物學(xué)家來(lái)說(shuō)是一個(gè)有**的工具。這些結(jié)果對(duì)給這種分析帶來(lái)希望的一個(gè)方法做了初步演示，并且有可能幫助從原本會(huì)被扔掉的樣本中揭示有關(guān)過(guò)去生物多樣性的信息。然而，還需要進(jìn)一步的工作，來(lái)可靠地逐步推斷有關(guān)遺傳多樣性的信息， 并將類別鑒定提高到物種水平。



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