應用背景
“下一代測序(NGS)”正**人類走向一個新的精密醫(yī)學時代。其目的是
精準定制**方案,基于基因數據庫為不同的病患者提供藥物,尤其是癌癥,
**和**疾病的醫(yī)療。越來越多的國家愿意建立對*癥的基因數據庫,
管理他們自己的基因。然而,在基因庫中有 6.4 億 DNA,它變成了 100GB
的數據,面臨的挑戰(zhàn)是如何有效的處理這些數據。
解決方案
基因測序加速解決方案是以科學方式為科研人員節(jié)省時間。它應用于全基因組
測序(WGS)、全外顯子組測序(WES)、癌癥診斷等領域。基因測序加速解
決方案提供一個無痛的升級過程,使用本地 BWA-MEM 和 GATK 處理種系管道
的二代測序。使用者可以在不更改工作流的情況下完成對齊、測序、標記復制
和變量調用的分析。隨著本機快速算法的加速,SNPs 和 INDELs 的整體精度為
99.9%,與原始軟件相同。此外,加速解決方案提供與原始軟件完全相同的輸出
文件格式。通過將研華 SKY-7210 服務器與偉薩科技的 FPGA 卡相結合,專為精
密醫(yī)療行業(yè)設計出一種優(yōu)化和加速數據處理的基因測序一體式服務器。
系統(tǒng)描述
基因測序加速解決方案是以科學方式為科研人員節(jié)省時間。它應用于全基因組測序(WGS)、全外顯子組測序(WES)、癌癥診斷等領域。
基因測序加速解決方案將 Intel?
Arria 10 張 FPGA 卡和研華 SKY-7210 2U 機架式服務器搭配,在服務器上部署大數據和深度學習提供了一個
平臺,支持高達 3TB DDR4 插槽、3x NMC(網絡夾層卡)和 2x 300W GPU 或 6x 150W GPU,有助于減少從 HDD 到 FPGA 的數據移動延遲,
為數據中心提供了良好性能和靈活應用。
生物信息采樣導入到DNA序列
母系(NIPT) 癌癥和疾病
WASAI FPGA
SKY-7210 2U機架式混合網絡服務器
FASTQ
醫(yī)療數據中心
為什么
選擇研華
? SNPs 和 INDELs 的整體精度為 99.9%,與原始軟件相同
? 基因測序加速解決方案使用本地 BWA+GATK 算法,可應用于多個程序
? 提供集成 FPGA 和服務器的一體化解決方案
? 種系分析變異管道處理時間從近 33 小時縮短到不足 8 小時
SKY-7210
2U 機架式混合網絡服務器
濟南研浩電子設備有限公司專注于研華工控機,研華原裝機,研華機箱等
詞條
詞條說明
車用信息娛樂系統(tǒng)是提供乘客必要信息與多元服務的工具
車用信息娛樂系統(tǒng)是提供乘客必要信息與多元服務的工具,而為了創(chuàng)造較大效益,軌道交通工具的車用信息娛樂系統(tǒng)還得在提供娛樂內容之外,兼具監(jiān)控與管理的功能。但也因為所需處理和顯示的訊息量大,強大靈活的硬件平臺成為系統(tǒng)能否提供高質感影音享受與高速無線傳輸的關鍵。集高性能、多種I/O配置、容易擴充、通過E**0155認證等特色的ITA-5831有足夠的能力可以處理車用信息娛樂系統(tǒng)的大量數據;客制化服務亦讓此款
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